View Summary Pdf File Gene model: Cs_Cb2.01g057170.m01
IDENTIFICATION
- Species Name
- C3H
- Locus:
- Cs_Cb2.01g057170.m01
- Gene Model:
- Cs_Cb2.01g057170.m01
- Description:
- CsC3H-06
- Family:
- C3H
- 3D Structure:
- Genome Databases:
- Tair
- Kegg
- External Resources
- GabiPD
- Gene Structure:
-
- Domain Architecture:
-
- Peptide Sequences
-
>CsC3H-06
MAVEEPQIETLKTSEALLHFPPHRRRHLQSQTYLTLVRIFSHCYNDSQPS
PSTHNLHKDLRNEKGSNELGQRTESQASQFVELVGSDNTQPQGLKSDKNT
EVNLNVDDKCSLDSRHSQQLSIDEIDKLMRIDENEDLPNQKDASDFQEPE
FGPELVLIDELECIVKGSEDTVLDNNSKPPVVSLVQNQSGIDEVVVFNNQ
KEHVDSKQIDSEMSVNVSQKALSLNNVVIGESVVRRENSEDIPSLLNTTV
LDAGTVRQQNDRELNYAAAMDLNNSSVSIIEAGKTERTEFHGENFSEASS
FNKTTLANTSGVNNGNDDKTTGEPDALKEVQEMSLKDMKLDESVSCGIMG
DVDMEEGEISGGFSVDDISMDMLLQDAVLLEGDKVNEESIPDKEELSCKV
ATERDSESTFFLLDNNNGMGFKESDKTKAVSKPDVSVNEILQRASKVDAN
DALLETTIIEKNNIVGSNKLVLHGIIEEDATDHDKPATEDSGKKKRRLPT
KERRAKKKLQKQKKRAENNRKLGVKRLKLPPILKPKTVSYCRHFMVGRCY
EGDKCKFSHDTVPLTKSKPCCHFARNSCMKGDDCPFDHQLSKYPCSNFAS
AGYCSRGDNCMFSHKSVPKEDATTSSNAMEPEKKVATLMNNSKFKEQLKE
KSACQQPFSVSSFSTGISSHKNTGKNKNETFLKQEKSVPKGINFLSVGSL
PLVDSVKLKQQILSPNRIAGAGVGNHLEQHGSGIVQNSNEILNKSAPIVA
PKGVNFLSFGRSQQDDFSSRTLVSTPSSGDSSVKLSSDNSVMLNQTNSAP
KSNLMLEGIQPAVTPKGINFFSFRKSSVNDSLDKLKLPFSCDDGSDSSVN
GRQYPLDEQKHSCTTSKTLPSSSVSLAQSPDPSSSRFHKDTAHSAQKALL
STLAFAAKHESRVKQNELIRDPSGGTEIDKGIRENSLIGGSQNGLAKVSR
IVELLSSFSGKSKQ - CDS (Coding Sequence):
-
>CsC3H-06
ATGGCAGTGGAGGAACCACAAATTGAAACACTTAAAACATCCGAAGCCCT
ACTGCATTTCCCTCCTCACCGTCGAAGACACCTCCAAAGCCAAACATATC
TTACTTTGGTTCGAATTTTTTCTCACTGCTACAACGACTCACAACCTTCT
CCTTCCACTCATAATCTTCACAAGGATCTTAGAAACGAGAAGGGCAGTAA
TGAATTGGGGCAAAGAACCGAGAGTCAGGCTTCTCAGTTTGTTGAATTGG
TTGGTAGTGATAACACACAGCCTCAGGGTTTGAAATCTGATAAAAACACA
GAAGTGAATTTAAATGTTGATGATAAATGCTCTCTGGATAGTAGGCATAG
CCAACAATTGTCAATTGATGAGATTGATAAGCTGATGAGAATAGATGAAA
ATGAGGATTTGCCAAATCAAAAGGATGCTAGTGATTTCCAAGAGCCGGAG
TTTGGCCCGGAACTAGTGTTAATAGATGAGTTAGAGTGTATTGTAAAAGG
AAGTGAAGACACTGTCCTTGATAACAATTCAAAGCCCCCAGTAGTTTCTT
TGGTTCAAAACCAAAGTGGCATTGATGAAGTGGTGGTATTTAATAACCAA
AAAGAACATGTGGACAGTAAGCAAATTGATAGCGAAATGTCTGTAAATGT
GAGTCAAAAGGCTTTATCTTTGAATAATGTTGTTATTGGCGAAAGTGTTG
TTCGAAGAGAGAATAGTGAGGATATACCATCTTTGTTGAATACAACAGTC
TTGGATGCTGGTACAGTAAGACAACAAAATGATAGGGAACTTAATTATGC
TGCTGCCATGGATTTGAATAACTCATCTGTTTCCATTATTGAAGCAGGGA
AGACTGAGAGGACAGAGTTCCACGGTGAGAATTTTTCTGAAGCCTCCTCC
TTTAACAAAACTACATTGGCAAACACTTCAGGCGTTAATAATGGAAACGA
TGACAAGACAACAGGGGAACCTGATGCATTAAAGGAGGTGCAAGAAATGT
CACTTAAGGATATGAAATTGGACGAGTCAGTTTCTTGTGGTATTATGGGG
GATGTAGATATGGAAGAGGGAGAAATTTCTGGTGGGTTCTCCGTGGATGA
TATTTCAATGGATATGTTGCTGCAGGATGCAGTGTTATTGGAGGGTGACA
AAGTAAACGAGGAGTCTATACCTGATAAAGAAGAGTTATCCTGTAAAGTA
GCCACTGAAAGAGATTCTGAGTCCACTTTCTTTCTCCTTGACAATAATAA
TGGAATGGGGTTCAAGGAAAGTGATAAAACTAAAGCTGTTAGTAAACCTG
ATGTTTCTGTGAACGAAATATTGCAGAGGGCTAGTAAGGTCGATGCAAAT
GATGCTTTACTGGAGACTACAATTATTGAAAAAAACAATATCGTTGGAAG
TAATAAGCTTGTATTGCATGGAATAATTGAAGAGGATGCAACAGATCATG
ACAAGCCTGCCACTGAAGACAGTGGTAAGAAAAAGCGGAGGCTTCCTACA
AAGGAAAGGAGAGCTAAGAAAAAATTGCAGAAGCAAAAGAAACGAGCAGA
AAATAACAGAAAGCTTGGTGTTAAAAGGCTGAAACTGCCTCCAATATTAA
AACCGAAGACTGTTTCTTATTGCCGTCACTTTATGGTGGGAAGATGTTAT
GAGGGTGACAAGTGCAAATTTTCGCATGACACAGTACCTTTGACAAAATC
CAAGCCTTGCTGTCATTTTGCACGTAATTCTTGCATGAAAGGGGATGACT
GTCCGTTTGATCATCAACTCTCAAAGTATCCTTGTAGCAACTTTGCGTCT
GCAGGCTATTGCAGCAGAGGTGACAATTGCATGTTCTCACACAAGAGTGT
ACCTAAGGAGGATGCCACAACTTCATCAAATGCTATGGAACCTGAGAAGA
AAGTTGCGACCTTAATGAATAATTCAAAATTTAAGGAGCAACTGAAAGAA
AAGAGTGCCTGTCAGCAGCCTTTCAGTGTTTCATCCTTCTCTACGGGCAT
TAGTTCTCACAAGAATACTGGAAAGAACAAAAATGAGACATTTTTGAAAC
AAGAAAAATCGGTACCTAAAGGAATTAACTTTCTCTCTGTTGGGAGTTTG
CCTTTGGTAGATTCTGTTAAGCTCAAACAACAAATTTTATCTCCAAATAG
AATTGCTGGTGCCGGGGTTGGGAATCATCTTGAACAACATGGATCAGGCA
TAGTGCAGAATTCCAATGAGATTTTAAACAAAAGTGCACCCATAGTAGCA
CCAAAGGGAGTAAATTTTCTTTCATTTGGAAGAAGTCAACAGGATGATTT
CAGCAGTAGAACATTAGTGAGCACGCCATCAAGTGGGGATAGCAGTGTGA
AACTGTCTTCTGACAATTCTGTTATGCTTAATCAAACTAACTCAGCTCCA
AAATCAAATTTGATGTTGGAAGGAATTCAACCTGCAGTGACTCCAAAGGG
AATAAACTTCTTCTCTTTCAGAAAATCCTCAGTTAATGATTCTTTGGATA
AGTTAAAGTTGCCATTCAGCTGCGATGATGGCTCTGATAGTAGCGTTAAC
GGGAGACAATATCCATTGGATGAACAGAAGCATTCATGCACAACCTCGAA
AACTTTGCCATCTTCTTCAGTTTCTCTTGCTCAGTCGCCAGATCCTTCAT
CATCCAGGTTCCATAAAGACACTGCACATTCAGCTCAGAAGGCACTCTTA
TCTACACTTGCATTTGCTGCCAAGCATGAGTCTCGAGTTAAACAGAATGA
GTTGATTCGAGATCCATCAGGTGGTACTGAGATTGACAAGGGCATCAGGG
AAAACAGTTTGATCGGAGGCTCACAAAATGGTTTGGCAAAAGTGTCAAGA
ATTGTTGAGTTATTGTCTAGCTTCAGTGGTAAAAGCAAGCAATAA - Nucleotide:
-
>CsC3H-06
AAAGAAAAGCAACAACGGGCAATCGAAACGCCGACCCCCATGAAAAACGC
CTGAGCCTGACCGGGGACCATCTTGTTGGTGTGAGCGAAACACTTCACAA
AACCCTCCTTCCTCTTCTTATTAGGGTTTTGGGACATTTGATAAAAGTAC
AGGACAGCGATGGCAGTGGAGGAACCACAAATTGAAACACTTAAAACATC
CGAAGCCCTACTGCATTTCCCTCCTCACCGTCGAAGACACCTCCAAAGCC
AAACATATCTTACTTTGGTTCGAATTTTTTCTCACTGCTACAACGACTCA
CAACCTTCTCCTTCCACTCATAATCTTCACAAGGATCTTAGAAACGGTAT
AAAACACTCAAACCCCAACTCAGTTATGGATTCGTTTGGTCACTGAATAC
CGAATTTTCATTCTAACAGCTGAATTTCTACAATTTTTAGCTTCACTTGT
AATCGAATAATTGATTGCTTCTTTCATGGAAGTTTTGTTATATTTTTCAT
TCATGATCAGGATCGAATTGTGTGTTTTTGTTTGTGCTTTTTCTAGCTTT
AGTTGTTTATTTTTCTATGATTGATTTTATTCTTCTGTATACAGAGAAGG
GCAGTAATGAATTGGGGCAAAGAACCGAGAGTCAGGCTTCTCAGTTTGTT
GAATTGGTTGGTAGTGATAACACACAGCCTCAGGGTTTGAAATCTGATAA
AAACACAGAAGTGAATTTAAATGTTGATGATAAATGCTCTCTGGATAGTA
GGCATAGCCAACAATTGTCAATTGATGAGATTGATAAGCTGATGAGAATA
GATGAAAATGAGGATTTGCCAAATCAAAAGGATGCTAGTGATTTCCAAGA
GCCGGAGTTTGGCCCGGAACTAGTGTTAATAGATGAGTTAGAGTGTATTG
TAAAAGGAAGTGAAGACACTGTCCTTGATAACAATTCAAAGCCCCCAGTA
GTTTCTTTGGTTCAAAACCAAAGTGGCATTGATGAAGTGGTGGTATTTAA
TAACCAAAAAGAACATGTGGACAGTAAGCAAATTGATAGCGAAATGTCTG
TAAATGTGAGTCAAAAGGCTTTATCTTTGAATAATGTTGTTATTGGCGAA
AGTGTTGTTCGAAGAGAGAATAGTGAGGATATACCATCTTTGTTGAATAC
AACAGTCTTGGATGCTGGTACAGTAAGACAACAAAATGATAGGGAACTTA
ATTATGCTGCTGCCATGGATTTGAATAACTCATCTGTTTCCATTATTGAA
GCAGGGAAGACTGAGAGGACAGAGTTCCACGGTGAGAATTTTTCTGAAGC
CTCCTCCTTTAACAAAACTACATTGGCAAACACTTCAGGCGTTAATAATG
GAAACGATGACAAGACAACAGGGGAACCTGATGCATTAAAGGAGGTGCAA
GAAATGTCACTTAAGGATATGAAATTGGACGAGTCAGTTTCTTGTGGTAT
TATGGGGGATGTAGATATGGAAGAGGGAGAAATTTCTGGTGGGTTCTCCG
TGGATGATATTTCAATGGATATGTTGCTGCAGGATGCAGTGTTATTGGAG
GGTGACAAAGTAAACGAGGAGTCTATACCTGATAAAGAAGAGTTATCCTG
TAAAGTAGCCACTGAAAGAGATTCTGAGTCCACTTTCTTTCTCCTTGACA
ATAATAATGGAATGGGGTTCAAGGAAAGTGATAAAACTAAAGCTGTTAGT
AAACCTGATGTTTCTGTGAACGAAATATTGCAGAGGGCTAGTAAGGTCGA
TGCAAATGATGCTTTACTGGAGACTACAATTATTGAAAAAAACAATATCG
TTGGAAGTAATAAGCTTGTATTGCATGGAATAATTGAAGAGGATGCAACA
GATCATGACAAGGTATTTACATCAAAGGTGTTTTTCTTTCTTTTCTGAAT
AAACATCAAATGTGTTTTACTGTCTTTTAAATTATTATGTATAGACTGTT
TTGTTCCTTGTGCAACTGCTCCAATACACATAATATATCAGGAAGTTACT
ATGAATAGAGTTGTATTGATATTTATTTATTTCAGGGTGTTCTATTAATA
GACTTTGTCTTCTTTCTAAGTGTTGATAGATTTTTATCAATAAGATAGCA
GGAAGATGCCATCATAATAGTTGTAGTCTTTTTGTCATTTTAGAGTGTTC
TTTCAATAGACTTTGTGTCATTTGTGAGTGCTAACATTTAGTGTTTGAGG
AATCTTTGTTTCAAACCGTGTGAGGTTTCTGGTCTTTAATATTCACTTTT
TTTTTTCATCACAGTGTTGAGTATATTGTTTCGGTGCAGTAATGTTTAGG
GTCTAATTTTTTGATAACCTGCTTAAACTGTAAAGAAATAAAGTTTTATT
TCTGTTTCCTATATACATATCCATATATGTATTTATATATTTACAGTGTA
TATACATTTTATGTATATAGCTTGCACTTCCCGTTGATTTGCAACCTTAG
ACACATTAAGTACTTGTTCAGCACTTTTTAATTGTTCTAACTAGATACTA
AGAATCATTTTTTTGTTGCGCTGGTCAAAAATTATTTTATACCTATATTT
GGACCGTTGATAACCGTGTGTTTTACTGTTGATCATTTGCAGCCTGCCAC
TGAAGACAGTGGTAAGAAAAAGCGGAGGCTTCCTACAAAGGAAAGGAGAG
CTAAGAAAAAAGTATTGTTTATACCTGTTCTATTTTATGTGGTTGCTTTA
TATATGTGCATGTGCATCAAAGTTTTGTTGGCATACCTTATTTGATTTGG
TAAAATCTGTAATCTTCCAAGAAAAATTTACTGGACTTCATGTGGTTATC
CTCTGCACTTATCTGAAAATAGTTTGTTATTTTTTTATATTCTAGTTGGT
ATAAGCTCTTTGTTTTTTTGTATACTTTTTTGTTAGTTGTATAGTTGATC
AATCATACAACTCTACAGTTGCAGAAGCAAAAGAAACGAGCAGAAAATAA
CAGAAAGCTTGGTGTTAAAAGGCTGAAACTGCCTCCAATATTAAAACCGA
AGACTGTTTCTTATTGCCGTCACTTTATGGTGGGAAGATGTTATGAGGTA
TGGTCTTCAACTCTTTATTTTTTGGCCCTGGCAGTTCGACCGGAAGACCT
CCCAATGGCCTCAAGAGTTATTTGAGTCTGTGGGGATTCAAACCTTTGAA
CAAATGCCATCCAGCACTTTCTAACACTCCTCTGTACCACTAGACCACCC
CTTGGGATTATGATCTTCCACTCTTATATTGAACATTGAACATTATTCGA
ACTATGATGTTTCCATTGATTCATAGTTTCACTTTGTGCTTACCCTAGGA
CAGAGGAATATTGATGTGCATGTTGGGAAACTTGCTAGAAAATTGCTTGT
TGTCAGTTGCATGCGTGAGCCTAATCATAATTATGAAAGAACTTATTAAA
TAACATGAAAGAAGTAATCAGTTAATCGATTCCTTTTGCTTTTGCTTTTA
GAATTCTCTGTATTGTAACCTTAGTTTCTTTGTGTTTCACAGGGTGACAA
GTGCAAATTTTCGCATGACACAGTACCTTTGACAAAATCCAAGGTATTGC
ATTAATTAAAACTTCTTGTTATTGTGCTTTCTCACACTATTTAAGTAACA
ATGTATCTTATAATATGATAAGTACACTTTGATAACAAATTGTTTCCATT
GGCAAATATTTTTCTATTTAGCTTCACATAATTTGTAGAACTATTGATAT
TACAGTTTGACACCTTAAGAAATTTCTCCCATACTTCGTAGGTCAATGCA
AATATCACAGTTCTTTTAACATTCCTCTCTCTGTTACAGCCTTGCTGTCA
TTTTGCACGTAATTCTTGCATGAAAGGGGATGACTGTCCGTTTGATCATC
AACTCTCAAAGTATCCTTGTAGCAACTTTGCGTCTGCAGGCTATTGCAGC
AGAGGTGACAATTGCATGTTCTCACACAAGGTACATTCTTTTGCCTGTGT
AAAATGATTGATTTAGCTCTTTTTATATCCAATTGCTTAACCTACTGCCT
ATAAATTTATACCCAGAGTGTACCTAAGGAGGATGCCACAACTTCATCAA
ATGCTATGGAACCTGAGAAGAAAGTTGCGACCTTAATGAATAATTCAAAA
TTTAAGGAGCAACTGAAAGAAAAGAGTGCCTGTCAGCAGCCTTTCAGTGT
TTCATCCTTCTCTACGGGCATTAGTTCTCACAAGAATACTGGAAAGAACA
AAAATGAGACATTTTTGAAACAAGAAAAATCGGTACCTAAAGGAATTAAC
TTTCTCTCTGTTGGGAGTTTGCCTTTGGTAGATTCTGTTAAGCTCAAACA
ACAAATTTTATCTCCAAATAGAATTGCTGGTGCCGGGGTTGGGAATCATC
TTGAACAACATGGATCAGGCATAGTGCAGAATTCCAATGAGATTTTAAAC
AAAAGTGCACCCATAGTAGCACCAAAGGGAGTAAATTTTCTTTCATTTGG
AAGAAGTCAACAGGATGATTTCAGCAGTAGAACATTAGTGAGCACGCCAT
CAAGTGGGGATAGCAGTGTGAAACTGTCTTCTGACAATTCTGTTATGCTT
AATCAAACTAACTCAGCTCCAAAATCAAATTTGATGTTGGAAGGAATTCA
ACCTGCAGTGACTCCAAAGGGAATAAACTTCTTCTCTTTCAGAAAATCCT
CAGTTAATGATTCTTTGGATAAGTTAAAGTTGCCATTCAGCTGCGATGAT
GGCTCTGATAGTAGCGTTAACGGGAGACAATATCCATTGGATGAACAGAA
GCATTCATGCACAACCTCGAAAACTTTGCCATCTTCTTCAGTTTCTCTTG
CTCAGTCGCCAGATCCTTCATCATCCAGGTTCCATAAAGACACTGCACAT
TCAGCTCAGAAGGCACTCTTATCTACACTTGCATTTGCTGCCAAGCATGA
GTCTCGAGTTAAACAGAATGAGTTGATTCGAGATCCATCAGGTGGTACTG
AGATTGACAAGGGCATCAGGGAAAACAGTTTGATCGGAGGCTCACAAAAT
GGTTTGGCAAAAGTGTCAAGAATTGTTGAGTTATTGTCTAGCTTCAGTGG
TAAAAGCAAGCAATAATGTATGTTGGTTTTTTGTTTACAAAGACCTGGGC
TCTTGACAGTTAATCATAAGAAAGGGGGTCATGTAGGCAATCCAATCAAC
TCAGTTTCAGAATACAGAGGTGGGAAATGGGAATGTGAAGGAATCTAGTG
TTCTTTCCCCCATTAGCAGCTCATAAGGTGGTTTGCTCTACTGTTTTCAA
CATTTGATACTCAGGTACCCTTTACTTTTCAAAGATTTTTAAAAATCACA
ACTGAACTTGGTAGTTAAGACGGATTGAAGCTAACTGGTGAGTTTGGGCC
AATCTTCTTTTCTTTCCTATTGCACCTTGGTAGTTTATGTGCTATATACT
ATTGACAAACCAAACATTGATTGGCAATCATGGGAAAGAAGTTGCTATCA
TTATCAATATTTTGTACATGAAGCCCAACTGCCTTCAATTTTGCAAGACT
TTAACACAATTGCTATACCTACCAGCTTGTCATTATTTTCATTCCAGAGG
CATTGTAAATATGATTGGTATTATGCAATTACTGTTTGTTGATTAATTTG
GAATTTACACATTTAGATATTTTTATTATTCTGACATGGATTCTGGCTTG
ATATGAAATTCACCTAAAATTATTTCTCAGTCGGCTCGGACTGAACAGTC
CCAATACAATCTTTTTAATCTGAAAGGTAAATCTTCAAATTGATGTCCAT
TATGGTTCAATGGCTGCCCATCGAAGTAGATGAGTGATTTATGATATAAA
AATAATTATAATTAAATTTTAGAAAAAGACTAGAGAGTAACTCAACTGGT
TGAGTGAATTCGTAAGGAGGAGATAGGACTAATTAAACTCTTATATATAT
ATATATTTATATATATCTATGTATATTTATATCATATTTTGTCTTCTATT
ATTTTTTTTTTGAACAATGCTTCTCTTATTTTTTAAATCAGAGAAAACCA
TGTTCTGGTAGGGACTGTACTTATTTCTACAATTGTCCTCATTTTGCAGA
AAACTCAAATATGTTCCTGAATCATGCGGTTGCCTTCTCACTCCAGCTGT
TTACCCTCAAAGCCAATTACAATACTGTGTACAAGGTAAAGGTACAATGC
CTTTGATATCACCATACAACAAAACCAACCAATTTCAGTTATAAGCTCCT
TGACAACTAGTGTCATTGCATAACTTTTTTGAGGGTGTCTTTAAATCAAA
GTGCTGTATCTCACGCAGAGTAAATAGCATTGGATCTGATAAAAAATAGA
GAGGAAAAAGAAAGAAAAAGGGGATCTTAATAAATTATTGTACTAGTATG
GTCTTGAAGACTCAATTATGTTTGCACCAGTCCAAATCAAGGACATGTAC
ATACATATAGGAAATATATCCCCAATTGGAACACTAATTAGTGTGAAACT
AAAGATTTTATAGTTTCAACTAAAGAGAAAAACATATTAATTTTGTTTTT
TGTGGTGTGGTTATCATTTGTACAAGGCAATCAAGGACGGGGTCGCCCTC
CAGTCTGTTGTGGGGATGACCAGTTGATTGTATCTTAACCCTTTTTCTCT
GCCAAATGTGTCTTTTAGTATTTTGGCCTATAGTTTGGGTTCTCTCTTTT
AGAGTAAAAACTATAAAATTACCACTTCCTTCATTTTCTTTTGTACATTT
TTTTTGTTTTTGTTTTGTCAAAGATTATAATGTCAAGGCAGGCAGCTGAT
TTTTCAAAATTTATTTGCTTTTTCATGCTCTTTTGTTTTTTGTTTTGTCA
ACATTAAACTGGAGGGCATCCATTAAATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTG
TTTTTTTGCTTTATTAAAAGAAGGTAGTATAATGAGAGTAGATATACAAT
TATATCGATCGTCCTATC